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生產方法賴氨酸的生產方法是提取法、發酵法、合成法，目前國內主要發酵法生產。賴氨酸的發酵可以用黃色短桿菌或谷氨酸棒桿菌為生產菌,一般以水解糖為碳源，以硫酸銨、尿素或液氮為氮源,以碳酸鈣為中和劑,再添加生物素、豆粕水解液、硫酸鎂、磷酸氫二鉀和磷酸二氫鉀作為培養基；滅菌后，接種2%經二級擴大培養的種子或10%經三級擴大培養的種子，在通風條件下，發酵約60h。發酵過程中，PH保持6.5-7.5,溫度前期32℃,中后期34℃。產酸水平約4%，糖酸轉Chemicalbook化率約30%。賴氨酸的提取一般以離子交換法，發酵液中加入絮凝劑（如聚丙烯酰胺）和助濾劑（如硅藻土）后過濾除去菌體等雜物；用鹽酸調PH至2-3，上柱（陽離子交換樹脂）吸附；水洗后，再用PH為9.5-12的氨水洗脫；在50-60℃下洗脫液真空濃縮除氨后用鹽酸調PH至5-6,析出賴氨酸鹽酸鹽粗品；最后將粗品溶于水，加活性炭褪色，過濾后冷卻結晶出L-賴氨酸鹽酸鹽成品。生產方法以微生物發酵法制得L-賴氨酸粗產品，經精制獲純品，然后在鹽酸中結晶得產品。