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纖維素酶的來源非常廣泛，昆蟲、軟體動(dòng)物、原生動(dòng)物、細(xì)菌、放線菌、真菌等都能產(chǎn)生纖維素酶。1.細(xì)菌:細(xì)菌產(chǎn)生纖維素酶的量較低，主要是EG，大多數(shù)對(duì)結(jié)晶纖維素沒有活性，而且所產(chǎn)生的酶是胞內(nèi)酶或吸附在細(xì)菌壁上，很少能分泌到細(xì)胞外，增加了提取純化的困難，在工業(yè)上實(shí)際很少采用。目前研究較多的是纖維素粘菌屬、生孢纖維粘菌屬和纖維桿菌屬。2.放線菌:對(duì)放線菌的研究很少。分枝桿菌和原放線菌幾乎不產(chǎn)纖維素酶或產(chǎn)量極低，產(chǎn)量稍高的主要是黑紅旋絲放線菌、玫瑰色放線菌、纖維放線菌和白玫瑰放線菌。3.真菌:目前用于生產(chǎn)纖維素酶的微生物大多屬于真菌，研究較多的有木霉屬、曲霉屬、根霉屬和漆斑霉菌。它們能產(chǎn)生大量的纖維素酶，其中尤以木霉屬的產(chǎn)量居多。李氏木霉和綠色Chemicalbook木霉等是木霉屬中酶活性較高的菌種。真菌產(chǎn)生三類纖維素酶，能分泌到菌體，一般不聚集形成多酶復(fù)合體，但相互發(fā)生強(qiáng)烈的協(xié)同作用。目前已制成制劑的有綠色木霉、黑曲霉、鐮刀霉，以及擬青霉和斜臥青霉等纖維素酶。4.酵母:由于纖維素酶工業(yè)化生產(chǎn)的需要，要求提高酶的產(chǎn)量、外分泌性和耐熱性。近來對(duì)纖維素酶基因克隆研究較多。雖然幾乎所有已克隆的基因都能在大腸桿菌中表達(dá)，但由于提取困難和表達(dá)水平低，目前將基因表達(dá)方面的研究轉(zhuǎn)向于真核表達(dá)系統(tǒng)，目前應(yīng)用較多的是酵母表達(dá)系統(tǒng)。酵母不產(chǎn)生毒素，用其表達(dá)纖維素酶基因，其產(chǎn)物高度糖基化，經(jīng)正確加工修飾后可直接分泌至培養(yǎng)基，表達(dá)水平高。如酵母表達(dá)的CHBⅡ、EGⅠ的產(chǎn)量可達(dá)100mg/L以上，并具有正常的生物學(xué)活性。